O órgão de tubos encontra-se situado no coro alto do lado da Epístola, com colocação lateral. A sua estrutura interna ao nível de assento, de tubaria e mecânica terá sido alterada, quando foi colocado no espaço onde hoje se encontra. É um órgão positivo de armário, com caixa construída em madeira de pinho de Flandres e posteriormente pintada. Este instrumento característico da escola de organaria Portuguesa, construído em 1818, por António Xavier Machado e Cerveira (1756-1828), possui o n.º de obra 87. Em termos artísticos apresenta características do gosto neoclássico.

The pipe organ is located in the upper choir on the side of the Epistle, with lateral placement. Its internal structure regarding its seating, tubing and mechanics is believed to have been changed when it was placed in the space where it is today. It is a positive cabinet organ, with a box built in pine wood from Flanders and later painted. This characteristic instrument of school the Portuguese organ school organ, built in 1818 by Antonio Machado e Xavier Cerveira (1756-1828), has the work number 87. In artistic terms it presents characteristics of neoclassical taste.​

Características técnicas / Technical characteristics
Âmbito do teclado C1 – c25 / c#26 ----- e 53
= Dó 1 --- dó 25 / dó#26 --- mi 53

Registação (Original)
Mão esquerda                               Mão direita
* Fagote                                          * Clarim
* Cheio de IV vozes +                     * Corneta de III vozes +
* Compostas de vinte dozena +      * Compostas de 12ª e 19ª +
* Dozena (tubos de 19ª) +               * Oitava Real e 15ª +
* Quinzena (parte da fachada)         * Flautim
* Flautado de 6 tapado                    * Flauta Travessa
* Flautado de 12 tapado                  * Flautado de 12 aberto.                                 (parte da fachada)

Nota: É provido de dois pisantes em balancete, que fazem mover uma corrediça que anula os cheios (registos marcados com o sinal de +)